Membongkar tabir kisah seputar sosok Bunda Maria, Kisah Gelap di Balik Mukjizat menghadirkan potret segar yang menantang keyakinan audiens selama sudah. Film ini menyelidiki deeper tentang kehidupan seorang perempuan yang biasa dianggap murni, menunjukkan bahwa di balik keluhuran itu, bersembunyi rahasia yang mengerikan. Satu perjalanan yang menggu